空间组学——基因表达的原位解析

将基因表达信息锚定于原位的空间坐标，还原生命的“位置”密码。

1. 10X Visium CytAssist (V2) 空间转录组

图：10X Visium CytAssist 6.5mm*6.5mm芯片示意图

（源自10x Genomics）

图：10X Visium CytAssist 11mm*11mm芯片示意图

（源自10x Genomics）

产品简介：将组织切片的整体基因表达谱与组织形态学结构相结合。通过将RNA从组织切片捕获到带有空间条形码的探针芯片上，获得全转录组范围内的空间表达数据。

技术优势：通量高，兼容福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）和新鲜冷冻（FF）样本，是探索组织结构和功能的强大工具。

应用方向：肿瘤微环境分区、器官发育图谱、病理切片分子机制解析。

2. 10X Visium HD & HD 3’ 空间转录组

图：10X Visium HD芯片示意图

（源自10x Genomics）

产品简介：Visium技术的高分辨率（HD）版本，将分辨率提升至近亚细胞级，能够以更高的精度解析细胞在空间上的基因表达模式。

技术优势：亚细胞级分辨率，实现更精细的组织区域划分和细胞通讯分析；HD 3’适用全物种。

应用方向：精细组织结构解析（如大脑皮层、肝小叶）、细胞邻域分析、微环境细胞互作。

3. 10X Xenium 空间原位检测分析

图：10X Xenium实验流程

（源自10x Genomics）

产品简介：基于原位杂交的颠覆性技术，能够在组织原位对数百至上千个预设基因进行超高分辨率（亚细胞）的定量检测。真正实现“看到”每一个mRNA分子在原始位置的存在。

技术优势：单分子分辨率、超高灵敏度、定量精准、可与免疫荧光（IF）共标。

应用方向：稀有细胞类型鉴定、细胞边界精确界定、神经环路解析、生物标志物原位验证。

4. 华大Stereo-seq时空转录组

图：华大Stereo-seq时空转录组实验流程

（源自华大官方）

产品简介：基于华大自主开发的时空平台，提供目前超大厘米级视场（13cm×13cm）和超高分辨率（500nm）的时空转录组技术。既能看清细胞级别的细节，又能把握器官甚至胚胎级别的全局。

技术优势：超大视野、超高分辨率、无偏倚的全转录组检测，非常适合发育生物学和大型组织样本研究。

应用方向：胚胎发育全景图谱、全器官尺度细胞图谱、疾病发生发展时空动态研究。

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